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我國科學家發(fā)布獨龍牛高質量基因組序列

  來源:中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所     作者:陳燕 張?zhí)炝?nbsp; 發(fā)布日期:2022-06-07
 
核心提示:近日,中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所牛遺傳育種科技創(chuàng)新團隊發(fā)布了獨龍牛高質量全基因組組裝序列,揭示了獨龍牛的起源與系統(tǒng)地位問題、染色體融合的分子機制以及環(huán)境適應性的遺傳基礎,對我國牛種質資源的優(yōu)異種質和基因的精準鑒定具有重要意義。相關研究成果發(fā)表在Nature系列期刊《通訊生物(Communications Biology)》。
  近日,中國農業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所牛遺傳育種科技創(chuàng)新團隊發(fā)布了獨龍牛高質量全基因組組裝序列,揭示了獨龍牛的起源與系統(tǒng)地位問題、染色體融合的分子機制以及環(huán)境適應性的遺傳基礎,對我國牛種質資源的優(yōu)異種質和基因的精準鑒定具有重要意義。相關研究成果發(fā)表在Nature系列期刊《通訊生物(Communications Biology)》。
  獨龍牛又稱“大額牛”,主要分布于云南省獨龍江和怒江流域,是我國唯一的半野生半家養(yǎng)的珍稀牛種。我國的獨龍牛與東南亞及南亞國家的大額牛一樣,其起源與形成史在分類地位上尚有爭議。早期研究表明,普通牛2號、28號染色體的羅伯遜易位可能形成了獨龍牛的1號染色體,但缺乏基因組學層面的支持。因此,構建基因組學研究平臺開展深入系統(tǒng)分析,成為解開獨龍牛起源和演化歷史之謎的鑰匙。
  科研人員利用二代、三代和10xGenomics等測序技術,成功獲得了獨龍牛高完整性和連續(xù)性的全基因組序列。通過比較基因組學分析,描繪了獨龍牛進化歷史,發(fā)現獨龍牛與牦牛、野牛一樣,在大約300萬年前的上新世晚期就從Bos牛屬中相繼發(fā)生分化,比家牛早了100多萬年,從物種形成時間和遺傳關系分析上,支持了獨龍牛是獨立的牛屬物種的分類學地位。為全面精準評價獨龍牛種質遺傳資源特性,科研人員通過多維度基因表達和生物途徑分析,整合了43個參與心血管循環(huán)進化的基因,發(fā)現獨龍牛已經進化出物種特異性MYH基因家族成員,以滿足其高山峽谷的特定環(huán)境下心臟生理功能的需要。
  該研究得到國家自然科學基金和中國農業(yè)科學院科技創(chuàng)新工程等項目資助。(通訊員 付松川)
 
  原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s42003-022-03298-9
 
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