瘦肉型北京鴨和肉脂型北京鴨新品種，是由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所和北京金星鴨業(yè)中心合作，經(jīng)過30年持續(xù)選育26個世代育成的瘦肉型、高飼料效率的Z型北京鴨（農(nóng)（10）新品種證第4號）和肉脂型、適合烤鴨專用北京鴨（農(nóng)（10）新品種證第3號）2個配套系，2006年分別獲得國家新品種證書。
與原始北京鴨品種9周齡、體重2750克、料重比3.5-3.8:1比較，新培育的北京鴨配套系飼養(yǎng)期縮短到6周，Z型北京鴨體重增加到3216克，料重比降低到2.26:1；南口1號北京鴨體重增加到3586克，料重比降低到2.48:1。
在選育過程中，建立了父本與母本品系的選種技術(shù)，利用多元回歸模型準(zhǔn)確估測了北京鴨活體不可度量性狀，創(chuàng)建了立體選擇北京鴨胸肌重、胸肌率的技術(shù)、“料肉比”選種技術(shù)，首次克隆了14個與北京鴨生長、繁殖性狀高度相關(guān)的功能基因，獲得了18個與北京鴨生長、繁殖性狀密切相關(guān)的可用于分子標(biāo)記輔助選擇的候選基因，將分子標(biāo)記技術(shù)用于北京鴨品系間的遺傳距離估計、配套系雜交利用，提高了新配套系的生產(chǎn)性能。根據(jù)不同生理階段北京鴨的能量、蛋白質(zhì)、鈣、磷、多種氨酸與維生素A、D、E、煙酸等需要量測定值與理想氨基酸模型，制定了北京鴨飼養(yǎng)標(biāo)準(zhǔn)，改進(jìn)了養(yǎng)殖方式。
北京鴨新品種極大地提高了養(yǎng)鴨效益，使原有的北京鴨消費市場進(jìn)一步擴大。2007-2009年，推廣父母代種鴨117萬只，生產(chǎn)商品肉鴨超過2億只；在10個企業(yè)推廣種鴨53.45萬只，出欄肉鴨1.6億只，累計產(chǎn)值40億元，經(jīng)濟效益4.4億元。
